.Netの正規表現はNFAタイプのエンジンを使っています。このNFAとは非決定性有限オートマトンの頭文字で、正規表現の書き方に依存した動作をするので うまい書き方をすると早く動き、下手な書き方をすると遅くなります。
NFAエンジンは可能性を持つ2つのオプションの中でどちらかを選ばなければいけなくなると、片方を選んで後で戻ってくる時があれば(つまり先に選択した方でマッチできなければという意味なので、必ず全てのパターンが試されるということはないということがわかります。) そこに戻れるように、もう片方も覚えておきます。
例１を見てみましょう。

例１）He said "This book is very fun." and "Read it. It's useful for you!" I intend to buy it.

正規表現１：".+"
上記の正規表現を例１に適用したとします。ここで、+の量指定子は貪欲にマッチするならどんどん進んでいくタイプです。ただ、進んでいくときにそこに別の選択肢（"で終わるかどうかという選択肢）もあるよという目印を置いていきます。 それが下の例１-１のです。これは途中経過で、.+が最後の.のところまで進んだところでそれ以上文字がないので"があるかチェックしますが文字がないので失敗します。 すると、先ほどのを右側から順に戻って行っていきます。tのところに戻ってきて後ろの文字が"かチェックしますが、.であるので失敗します。 そしてまた左隣に戻ってiの次が"かチェックしますがtなので失敗します。
これを繰り返して!のところまで戻ってきて右隣りが"であることを見つけますので、ここで成功します。
得られる結果は、"This book is very fun." and "Read it. It's useful for you!"となります。

例１-１）He said "This book is very fun." and "Read it. It's useful for you!" I intend to buy it.

次に例２を使って考えてみましょう。

例２）I asked him "Lady Gaga, The President, and which is great?" He happily replied "Lady GAGA!"

正規表現："[^",]+"
上の正規表現は、"で始まって、"と,以外の文字が続いて、"で終わる部分を抜き出すというものです。
これを例２に適用すると、最初の"を見つけると次の文字が"と,以外の文字か見てLであるので次の文字もそれら以外の文字か見ていきます。その時に別の選択（"にマッチするかという選択肢）もあるよという目印を置いていきます。 そして、どんどん見ていくと例２-２の状態になります。,の手前まで来たところで[^",]+のマッチが終了し、そして"でないので失敗です。そして、左隣に一文字戻りますが、aなので"ではないので失敗です。これをどんどん戻って行って、 最後はLの直後まで戻ってみるが隣はaなのでこの正規表現はここの部分は失敗です。

例２-２）I asked him "Lady Gaga, The President, and which is great?" He happily replied "Lady GAGA!"

先ほど失敗した,のところまで進んでスペースから再開します。"ではないのでどんどん進んで行って?の隣の"を見つけます。そして、右隣りもスペースなので[^",]+がどんどん進んで行って例２-３の状態になります。そして、repliedの後の"で[^",]+の部分がマッチしないので次の"にマッチするので、マッチが成功です。
よって結果は" He happily replied "となります。

例２-３）I asked him "Lady Gaga, The President, and which is great?" He happily replied "Lady GAGA!"

アトミックグループの場合はまた違います。
アトミックグループは貪欲で、バックトラックしません。つまり、別の選択肢を捨ててしまいます。例３を見てみましょう。

例３）I asked him "Lady Gaga, The President, and which is great?" He happily replied "Lady GAGA!"

正規表現："(?>.*)[?]"

上記の正規表現を使うと、結果から言うと一致するものはありません。詳しく見ていきましょう。
正規表現の最初の"は最初に出てくる"でまず止まります。するとアトミックグループ（(?>...)の部分）に入ります。正規表現が.*なので最後まで一致してしまいます。アトミックグループを出たところで別の選択肢であるは、アトミックグループの中については全て捨てられます。 ここで[?]"に一致できる部分はないので、マッチは失敗します。
では、次の正規表現ではどうでしょうか。

正規表現："(?>.*[?])"

結果から言うと、"Lady Gaga, The President, and which is great?"が一致する部分です。このうち、アトミックグループの部分に一致するのは、
Lady Gaga, The President, and which is great?
ですが、アトミックグループ内だけの動作を見ると、おそらく次のようです。
アトミックグループ内に入ってきたときは、正規表現エンジンが注目しているのはLの左側です。アトミックグループの最初の正規表現部分が.*なので、一致するのが0こでも良いのですが貪欲なので 一気に最後の"のところまで進みます。その時、他の選択肢のは全ての文字の間に置かれます。
Lady Gaga, The President, and which is great?" He happily replied "Lady GAGA!"
つまり、アトミックグループの中だけを考える時はバックトラックがあるということです。 そして、そのままではアトミックグループ内にある[?]の部分が一致できないので左にバックしていって、「great?」の?にマッチして、アトミックグループの外に出て、その時に左側にある残りのが全て捨てられます。