HttpResponseMessageの中のすぐのHeaderプロパティではなく、Contentの中のHeaderプロパティの中にあります。
//HttpClientで接続
HttpResponseMessage res = await httpClient.GetAsync(httpUri);
//コンテンツのタイプを取得
//普通のHTMLなら、text/htmlという具合に取れるはず。
string strContentType = res.Content.Headers.ContentType.MediaType.ToString();
